As técnicas cromatográficas apresentam muitas variáveis experimentais que devem ser avaliadas durante o desenvolvimento de um método analítico, tais como: tipo de fase estacionária (FE), natureza do solvente orgânico, força cromatográfica, gradiente,  pH, temperatura da coluna, vazão da FM etc. Uma das linhas de pesquisa do laboratório enfoca a metodologia de Analytical Quality by Design, que busca otimizar o desenvolvimento analítico por meio de métodos de planejamento experimental (Design of Experiments, DOE). Métodos cromatográficos otimizados são alcançados por meio de modelos matemáticos que descrevem a importância das variáveis experimentais e suas interações nas respostas (tempo de retenção, resolução, eficiência, assimetria etc).  Esta estratégia tem sido largamente incentivada na Industria Farmacêutica moderna.

O laboratório conta com os softwares Design Expert (versões 9 e 11, StatEase, Minneapolis, EUA) e Fusion QbD (S-Matrix, California, USA), sendo este último interfaciado com o software Empower, o que  permite a automação dos experimentos para execução e posterior análise multivariada.